家族的矛盾埋下了隐患，从此以后仁蚌家族获得了发展的条件。
扎巴坚赞去世后，最终继承帕竹大权的是扎巴坚赞的侄子扎巴迥乃，他是两大家族通婚后生下来的第一个后人。虽然继承者是两大家族共同的后人，但是这并没有能够调和两大家族的矛盾。最终两大家族矛盾激化，还发生了内乱。在这次内乱中，仁蚌家族成了赢家：位居帕竹大臣的仁蚌家族的巴诺布桑波夺取了后藏地区的几个宗。从此有了与帕竹家族分庭抗争的资本。而从这以后，帕竹政权逐渐走向衰落。
在之后的六十多年里，仁蚌家族与帕竹家族的冲突不断，而在这个过程中，仁蚌家族表面上做出拥护帕竹政权的管理，实际上竭尽全力的扩充自己的势力，时削弱帕竹政权的统治基础。
1499年，羽冀丰满的仁蚌家族开始与帕竹政权公开冲突，随后一些地方势力也不断向帕竹政权发起挑战，西藏又开始了战乱不断的历史。以后，帕竹政权相继还出现过多位领导人，但是历史对此记载并不详细，可以感觉到在这一百多年里，帕竹地方政权已经是名存实亡的状态。
仁蚌家族利用联姻的方式扩充了自己的实力，进而在帕竹地方政权名存实亡的时期几乎控制了前、后藏地区的统治权。
由于明朝与元朝的统治方式不同，明朝皇帝以仁德治西藏。明太祖朱元璋在南京称帝的第二年（公元1369年），就派遣官员持诏谕前往西藏，着令各部归顺明朝。
诏书说到朱元璋“命将率师，悉平海内。臣民推戴为天下主，国号大明，建元洪武。式我前王之道，用康黎庶。惟尔吐蕃，邦居西土，今中国一统，恐尚未闻，故兹诏示
第五十四章八千里草原与黄沙(5/8)